Las células responden a los estímulos alterando la expresión génica, y los complejos RNA-, proteína impulsan casi todos los procesos de regulación de la expresión génica al nivel postranscripcional, como el proceso de corte y empalme, la exportación nuclear, la estabilidad del RNAm y la traducción. Por consiguiente, la comprensión de la regulación génica depende de la caracterización de los cambios acaecidos en la unión al RNA en estos diversos procesos. Tradicionalmente las interacciones RNA-proteínas se han identificado mediante cribado de genotecas de expresión en levaduras y bacterias o mediante selección in vitro, cuyos resultados se ven afectados por las limitaciones del sistema, los sesgos o los artefactos. Por el contrario, los datos obtenidos mediante RIP muestran una mayor relevancia biológica al permitir a los investigadores alcanzar sus objetivos con mayor rapidez.

Según comenta el Dr. Robert Nakamura, CEO de Avanced Genetic Systems, una compañía de biotecnología que valida los complejos RNA-proteína como dianas terapéuticas, “sabemos que una proteína de unión al RNA puede unirse a diferentes dianas de RNA dependiendo del contexto fisiológico. Aislando los complejos intactos de las células podemos identificar las interacciones específicas entre las moléculas y, posiblemente, alterar estas interacciones para obtener beneficios terapéuticos.”

La aplicación RIP puede considerarse como el análogo para el RNA de la aplicación mejor conocida ChIP (inmunoprecipitación de cromatina), que identifica dianas de ADN de las proteínas de unión al ADN. La RIP consiste en la inmunoprecipitación de las proteínas seguida de la purificación y la caracterización de sus RNA asociados. Teniendo en cuenta el conocimiento cada vez mayor del papel del RNA en la regulación génica, el desarrollo de métodos más eficaces de identificación del RNA, la validación de más anticuerpos frente a las proteínas de unión al RNA y, ahora, la disponibilidad de los kits RIP, se prevé una aceleración del ritmo de la investigación mediante RIP.

El kit Magna RIP de Millipore contiene todos los reactivos necesarios para el aislamiento cuantitativo de complejos RNA-proteína con moléculas de RNA intactas, de longitud completa. Los reactivos son perlas magnéticas de proteína A/G optimizadas para unir inmunocomplejos de ácido nucleico-proteína, inhibidores de RNAsas, tampones carentes de RNAsas, y controles positivos y negativos. Millipore ofrece también conjuntos de anticuerpos RIPAb+ / cebadores validados especialmente diseñados, anticuerpos de RIP validados y más de otros 80 anticuerpos que reconocen las RBP.

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